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| Accession Number |
TCMCG016R05442 |
| RNA Id |
AWWV01007761.1_mrna_5442 |
| Length |
5775bp |
| Locus_tag |
CCACVL1_05692 |
| db_xref |
InterPro:IPR000477 |
| Organism |
Corchorus capsularis |
| Molecule_type |
mRNA |
| Product |
reverse transcriptase |
| Location |
join(9993..10268,10500..12005,12092..13485,13614..16212) |
Sequence:
ATGGATCTGGAAATTGAACTTGAGACTGGCATTGATGAGGGTCTGGAATGGTCCAAATATATGGCTATTGGCAAGATTCATGCCAATAAGATCCTGAATCGCAGAAGAGTGATGGCGATTTTGCGAAGTATCTGGCCTGAAGAAGTGGCGCCGAGTATTAAGGAAGTAGGAGATAATACTTATGGGATCTCGTTTAATTCTGAAAGAACCAGGGATAGAGTTATTGGTTCAGGATCTTGGTCTATTATGGGATCCTGTATGAATCTGAAAAGATGGGTTCCAAGAAAGGGACGAGGGAAGATTTGGGCCTCTGTTATGTATGAGCGTCTTGGTGATTTCTGTTACTCTTGTGGAAAATTGGGACATATGGCCAAACACTGTCATGATGAGGTCAAGATTGGTCCTGATGGTAAACCTCTGTATGGCCCCCATTTAAGGGCTGGTAGTATGAAAAATGATCAAGGCAATATGAATTCTGAGATGGAAAAATGGAAGAAATGGAAAAGTAAGGATATGGCTCTTGTTATTACTGATGCAGAACATAGAGTTGAGGATGTGGCCAGGGAGAAATGGGGAAAACAGTGGCAAGTTGATAAATGGAATTCTGGGGTCCCTAATAGTGATGTTATGGAAATTGACACTGCTAGGAGGAATAAGGGGAAGAATCCTGTTGCTGACAATAATGTTCATGTACAAGATGGTCCTGGTTTCATTTTTTCTACATTAGAGACAGAGAGAAGAATTAATACTAATAATGCTGCATGTGTAAATATCTCTGATAACACAAATAATGATTCTCTTCATACACCTATTTCTTCACAATCAAAACCTATTCTTCAAAATACGGAAATATTAGAGCCACATAACTCCATTCATATTATAGATTTTGCTGCTTTAAATCCTCCTGTTCATAGCACTAAAAATCTTGAACCTACTTCCCTTGGTCTTTCTTCTAAACCTATTAAGCCTACTTCTTCTTTTCAAAACATTGTTTTATCTGATTCTATCTCTCCTATAACCCAAAATATTATTTCAGATAACATTCCTGCTTCTGATTATCCTGCTATTCAAGCTCCTGATATTGTGTTACCTATCGTTCAGTCTCCTACTCATTCAAACTATGATGATGGTACCCCTTGCCCTCTGCTTTCTGGTGATTCTTATGATACCTTTCCATACCCTGTTATGCCTGGAAGTTATCAGTATCCGGATTTAATTGTAAATGAAGGGCATGATAATGTTTACGAGTTGGGATCTCATAAAAGTATCAATGGGGAGGAAGTTCATGATGGTGAGGAAGTGTGTTCAGAATATAGGGGTTTGGATATTATTCAGGCTACTGGAAAAGTTGTTCCTTGTGATGAGAATGTTTTTCATGATGAGTTAGTTGAACTCAAAAGGGTGGTTGAGAAAAATACTGGTCTGATTGAATCTTCCTTGGTAGCTGAACTTAGGTGCTTGAAGTTAAAAAGGGGAGCTGATGTCCACATGCTGGAAGATGTTGATTCTAATGTTGAGAAAAGGAGGAAAGTGTCTGATGAAAATCCTTGGAGTAGGAAGGATTGGTCCTTGATTGAGTCTGAGCTTTTTCCTGTAGAGATCAGGCAAGTGACAACTTTTACTTATGGGAGTCGATCTGTGTGGGCAAGTAGAGGTGGTAGAGGAAAGAGCAAATGTATCAGGAAGAAGAGAAGTTGTACTGTTACTGAGGAAGGGTATACTGATGTTCGGATTATAGAAGATTGTTCTATTGGAAGATATTTGGGGTGGAATGATGAGCAAGGAATTGGGTCATCCCAGGCAGTTGAGGCTCTACATGAGCTAAGGAGAAAGTTTGACCCTGATTTCATCTTTCTGATGGAGACCAAAAATAGACAGGAGAAGTTAGAAATGATCAGAAAAAAGATGAAGCTTGATTGTGCAATTTATGTTGATCCGGATGGGCTTAGTGGTGGTATTGCTTTATGGTGGAAGGATTTTTTCAGTGTTAAAAGTATTGAAGAGAGTAAGAACCTGGTTGACACTGTTATTATTGATAATAGAAGTGGTGGTAGTTTTCGAATTTTATGGGTATATGGGGCTCCTGTTTTTGAAGATAGAAAACTGGTGTGGGAAAGAATTAAAAGAAAGGCTCTGATTATTGATGAAGCTTGGTGTTGTATTGGAGATTTTAATGATATTTTGGATGATAGTGAGAAAGATGGGGGTCCCTTGAAAGATAGAAGGTATATCAGGTATTTTCAGGATATGGTAGAACATTGTCAGTTGATTGATATCCAATTTCAGGGGCAGAAGTTCACTTGGATGGGAAAAAGGGATGATTTTGTTATAAAGGAGAGACTGGATAGAGCTTTTGTGAATCCTCAGTGGTTGATGGCTTTTCCTCATTCTCAATTGTTGATACAACCTGCTATTGGGTCGGATCATTCACCTGTGATTCTGAACTCTTGTTGGCAGGATATAAAAGGGCCTCGGAAGTTTAAATTTGAATCTTACTGGACGGATGTGGAGGATATTAGGTCTGTTGTGAAGACTAGTTGGGATGTTCATGTGGATGGTTCTAAAGCTTATCTGCTTGCCCAAAAACTTAAGAACTATAGAAAGTTGATTAAATTGTGGTGCAAGGAACAGAATAAAACTAAAGAACATAAGGATGAGCTTCTGAAGGAAATTGCTCTTCTACAAGATGGGGCCTGTACTGAGGAAGAACTTCAAAAAATTAAGGTGTGTAAGGAAAATGTGACTGCAATTTGGTTACAAGATGAGAAACATTGGCATCAGCGGTCTAGAATTAATTGGATTAGTTGGGGCGATCAGAATACCAAGTTTTTTCATCAGTCTACACTTCAGAGAAGGCAGTTCAATAAGATTCTTAAGATCAAAAATAATAGTGGGGATTGGATTGATAAGGAAGAAGACATTATGGAGAATTTTTGTCAGTTTTATGAAGATTTGTTTACCAGTGAGGGTAATAGAGATTGGGATGAGGTCCTTGATGTTGTTCCTTGCTTGATTTCTGAAGAAATGAATGTTAATCTGACTAAGGAGATTACTGATGCTGAAATTTATCAAGCTGTGTTTCAGATGGGCAGTCTTAAGTCTCCTGGGCCTGATGGGTTCAATGGTCTTTTTATCAAAATTATTGGGAAATTTTGGGCTATGATGTTAAAGCTATGCTATAAAATCATATCTACGATCCTAGTCAACAGAATGAAGCCCCTGCTTGGAGATATAATTACTGAAGTGCAAAGTGCCTTTGTTGAAGGTCGTCAGATTCATGACAATATTGTGGTTGCGCAAGAGGCATTTCATTTTCTAAAAGTGAAGAAGAAAGGAAAATCAGGGGCTGTTGCTTTAAAGGTAGATATGAATAAAGCCTATGATCGTGTTGAATGGGGCTTTTTTCATGCTTTACTTTTAAAAATTGGTTTTAATAGTAATTGGTGTGATTGGGTCTTAGAATGTGTAAGGTCTGTCTCGTATACTATAGTTATTAATGGCAAATCAAGTAGGATGATTTTTCCTTCTAGGGGTCTTAGACAAGGGGATCCTTTATCCCCTTATTTGTTCCTCTTAGTAATTGATACCCTTTCTAGGATGATCCAATTAGGAATTCACTCTGGTTACATTACTGGCTTGAATCTTGCTCGAAATTGCCCTATGATTTCTCACCTTCTATTTGCTGACAATTCTCTTTTCTTTATGGATGCTAACCTTGATAATTGCAAGAGGTTTTTTGAGATTATTCAGGGCTTCTCTGATGCTTCTGGTCAGAAGATAAGTCTGGCCAAATCAAGTCTGATCTTTAGTTCCAACATGAAGGAGGAGGATAGAGCAGCTATTGTGAATGCTTTGGGTGTGAATGAAGCCGCTATTCCCGGAACATATTTAGGGATACAGAATTGTTGGGGCAAAACCAAGTGTGGTGCAATGGCATATGTTAAGGAAAGAGTTGTAGCCAAGTTAAAAGGATGGAAACAAAAATATCTTTCTATGGGAGGTAAGGAGATCATGATTAAGGCAGTAGCTAGTGCTTTACCTGCTTATGTCATGTCTATTTTTAAGATTCCTAAGAAAGTTTGTAAAGAGATGCAATCTGCTATTATTAATTACTGGTGGGGACAGACTGAAAATGAAAGGAAGATCCACTGGTGTGACTGGCAGAAACTTACTGATCTTAAGCAAGATGGTGGCATAAGGTTTAAAGAATTTGAGGTTTTCAATCTGGCATTACTTGCTAAACAGGCTTGGCGAGTTACTGAGTATCCTAATGCCTTGTGGGTGCGTGTCTTAAAGGGTATTTACTTTCCTAATTCTGAGTTCTTTGATGCTGGTCAAGGAGCGAGGCCCTCTTGGATTTGGAATAGCTTGCTGGAAGGGAGGTCTCTTCTTCAAAATCATTTATTATGGGTTCCAATGGATGGGAAGAGTATAAGTATTTGGAGAGATAATTGGATACCTAAGCTAAATGGCAGGGTACTTGGTGATTTGAGCAGTATTGATGAAGATATTCCTCAACTGGTGCATGAAATTATGGATAAGAATGAGGGTACATGGAAGTTAGAGGGTATTAAGCAGTGGATTTCAGAAGAAGAGCAAGAAGCAATTTTAAGCATTCCAGTTCATGAAGGTGGAGAACATGATAAAAGAATTTGGCCGCATGACAAATCTGGTGTGTACTCTGTAAAGTCTGGATATGCATCCCAGAAGGCTGCCACACGACACAGTACTTGTTCCAGAGCTTCTTCATCTCATCAAATAGATAAGAGACTATGGAAAGTAATTTGGAGTATTAAAGCTCCATCGAAAGTTAAGGTGTTTTTATGGAGAATGTGTCGACATGCTTTAGCTACAAATGAAGAGTTATGGAAAAGAAAATGCCTAGATGAGCCTATTTGTGTGTTATGTGGTGAAGATGTGGAGTCTGTTGAACATTTGATATTGTTATGCCCCTGGACTCGAAAAGTGTGGTGGCAAGGGTGTTTTGGTCTGAAGATTTG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